Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr1aQ62266 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms