Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpaQ62189 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms