Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sin3bQ62141 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms