Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nfe2l1Q61985 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfe2l1Q61985 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms