Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msi1Q61474 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msi1Q61474 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms