Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smarcd1Q61466 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms