Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsx2Q61412 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsx2Q61412 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms