Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2bQ61313 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2bQ61313 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms