Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usf1Q61069 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf1Q61069 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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