Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Klf3Q60980 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms