Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms