Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2cQ60772 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms