Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf3Q60765 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms