Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcf4Q60722 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms