Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P4ha1Q60715 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P4ha1Q60715 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms