Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgaeQ60677 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgaeQ60677 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms