Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc125Q5U465 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms