Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc42Q5SV66 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms