Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms