Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlha9Q5RJB0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms