Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf1Q5ND28 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms