Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms