Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clhc1Q5M6W3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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