Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH2

Tsr3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr3Q5HZH2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr3Q5HZH2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms