Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms