Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3558Q5FWC9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm3558Q5FWC9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3558Q5FWC9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm3558Q5FWC9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3558Q5FWC9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3558Q5FWC9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm3558Q5FWC9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm3558Q5FWC9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm3558Q5FWC9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3558Q5FWC9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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