Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms