Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms