Protein–RNA interactions for Protein: Q505G8

Znf827, Zinc finger protein 827, mousemouse

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf827Q505G8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf827Q505G8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf827Q505G8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms