Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otol1Q4ZJM7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms