Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc3lQ4KL14 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc3lQ4KL14 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms