Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn3Q499D0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms