Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Smim26Q3V460 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim26Q3V460 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms