Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Carmil2Q3V3V9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Carmil2Q3V3V9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms