Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms