Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc43Q3V0L5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lrrc43Q3V0L5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Lrrc43Q3V0L5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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Lrrc43Q3V0L5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Lrrc43Q3V0L5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc43Q3V0L5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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