Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Prdm6Q3UZD5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Prdm6Q3UZD5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Prdm6Q3UZD5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prdm6Q3UZD5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prdm6Q3UZD5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prdm6Q3UZD5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prdm6Q3UZD5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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