Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E330034G19RikQ3UWX6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms