Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn4Q3UV66 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn4Q3UV66 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms