Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B230104I21RikQ3USW4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B230104I21RikQ3USW4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms