Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Znf48Q3US17 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Znf48Q3US17 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Znf48Q3US17 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Znf48Q3US17 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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