Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms