Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms