Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ell2Q3UKU1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ell2Q3UKU1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ell2Q3UKU1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ell2Q3UKU1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms