Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b2Q3UJB0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms