Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc34Q3UI66 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc34Q3UI66 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms