Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf44Q3UHJ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms