Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms