Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mier3Q3UHF3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mier3Q3UHF3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms