Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rreb1Q3UH06 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rreb1Q3UH06 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms